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当全基因组选择遇上胚胎工程技术

来源:九游APP总区生物畜牧种业 日期:2023-06-05
九游APP总区生物

遗传育种 全基因组选择技术

01.何为全基因组选择技术?

全基因组选择即全基因组范围的标记辅助选择,指通过检测覆盖全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体进行遗传评估,以期获得更高的育种值估计准确度。全基因组选择技术与常规育种方法相比,具有可以进行早期选择,缩短世代间隔,加快育种进程等优点。

全基因组选择方法是利用基因芯片技术实现规模化的 SNP 标记多态检测。基于各国积累的大量后裔测定遗传评估结果,实现单个遗传标记或多个遗传标记比对构成单倍型的遗传效应估计。目前,主要奶业国家青年公牛选择100%应用基因组评估技术,提高了后裔公牛的选择准确性。据相关研究表明,基因组选择方案可将乳用种公牛完成可靠选择年龄提前 3 年,遗传进展的速度提高 2 倍。

青年公牛

02.全基因选择有哪些优势

与传统育种技术相比,全基因组选择技术一方面不依靠候选群的系谱和表型信息,即可实现早期准确选种,能大幅缩短世代间隔,从而提高遗传进展,降低育种成本。而且其适用性强,不受环境等因素的影响,就可直接评估候选牛只的基因组育种值,可在更广范围内推广,可谓技术优势非常突出。

1.能够捕获所有的遗传变异,增加遗传评定的准确性;

2. 构建参考群,估计出SNP效应值后,对于候选个体不依赖表型信息即可选择;

3. 选择准确性更高(70%~90%),且可准确评定一些难于测定的性状、表型缺失的性状、遗传力低的性状、表现较晚的性状、新定义的性状和限性性状等;

4. 可以早期选择(缩短世代间隔);

5. 降低育种成本(如果代替传统后裔测定体系,可以节省92%的育种成本);

6. 大幅度提高育种进展(20%~50%)。

青年公牛

03.当全基因选择技术遇上胚胎工程

近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,全基因选择技术已成为奶牛育种的标准方法,并被广泛应用于选择种子母牛(公牛母亲牛)、选择供体母牛(胚胎生产)以及更多的遗传缺陷检测等方面。全基因选择技术与胚胎工程技术的结合更是已成为当下遗传育种领域的热点,全基因选择与活体采卵(OPU)、体外受精(IVF)及性别控制技术的组合应用正逐步成为牛繁殖育种的重要手段。作为一家国家级高新技术企业,九游APP总区生物也更好地集成了“全基因选择技术+OPU+IVF+性别控制技术”技术体系,并应用到了日常的工作生产中,如通过基因组检测,公司利用群体前10%的优秀母牛作为供体生产胚胎,移植到后20%的受体母牛,让牧场快速的完成高产群体置换,提升群体生产性能水平等,为国内市场带来了更为有效的生物育种、遗传改良、良种快繁方案。

集成全基因组选择技术、活体采卵、体外受精、性别控制技术,可以大大提高遗传育种的定向性和可预测性;并在短时间内用优良供体母牛生产大量胚胎,如1头供体高产奶牛4个月预计可生产40-50枚胚胎;而且通过体外受精技术可以提升性控冷冻精液的使用效率,让原本只能用于1头母牛受精的性控精液可以同时用于多头母牛受精;如果在母牛性成熟前采卵生产胚胎还可缩短世代交替时间等。目前该技术的产业化已经非常成熟,美国、加拿大和欧盟国家等均已广泛应用。

全基因组检测评估

04.当全基因选择技术遇上胚胎工程

值得关注的是,奶牛基因组选择的成功促使整个肉牛行业也在育种计划中引入基因组选择。在一些肉牛品种中,基因组选择也已经得到了较大规模的应用。以美国为例,在2015 年时便已有超过5.2万头安格斯牛被基因分型用于GEBV评估(Lourenco et al., 2015)。在肉牛全基因组选择育种方面,我国也构建了西门塔尔牛资源群体的相关数据库。不久前,中国农科院北京畜牧兽医研究所牛遗传育种科技创新团队还成功构建了国际首个肉牛高质量组织基因表达图谱。该图谱为新基因挖掘及功能验证提供了重要数据库,并为深度解析肉牛品种形成过程性状遗传基础及调控机制提供了理论支撑。相信在人们对更高品质肉、奶等蛋白产品需求持续增长的背景下,全基因组选择的应用会越来越广泛,必将在畜牧行业遗传育种领域发挥更大作用。

牛群

参考文献: 张顺进,寇浩玮,丁晓婷, 等. 2021.全基因组选择技术在反刍动物遗传育种中的研究进展及其应用[J]. 农业生物技术学报, 29(3): 571~578. 董晓晨,王铂,等. 2020.浅谈“引进全基因组选择技术自主培育天津地区顶级种质奶牛”方法[J].奶牛,5: 67~69.

所属类别: 行业动态

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